เมื่อถึงฤดูกาลที่ 3 การ์ตูนเรื่องห้องทดลองของเด็กซ์เตอร์ได้ถูกเปลี่ยนมือจาก Hanna-Barbera Cartoons มาเป็น Cartoon Network Studios ทำให้เกิดเหตุการณ์เปลี่ยนแปลงเนื้อหาในการ์ตูนหลายๆอย่าง ไม่ว่าจะเป็นชื่อที่แท้จริงของแมนดาร์ค (ซูซาน) พ่อแม่ของแมนดาร์ค นอกจากนั้นฉาก ลายเส้น และเนื้อหายังเปลี่ยนไปหมดอีกด้วย (โดยเฉพาะแมนดาร์ค ที่มีบทบาทเด่นเกือบทุกตอน) แต่ยังคงมีการเปิดเผยเรื่องราวสำคัญๆ เช่น วันที่พ่อพบรักกับแม่ เป็นต้น ซึ่ง Gendy Tatakovsky ไม่ได้เป็นคนผลิตในฤดูกาลนี้ เพราะขณะนั้นกำลังติดงานสร้าง สตาร์ วอร์ส : สงครามมนุษย์โคลน และ ซามูไร แจ๊ค อยู่